در اولین مرحله (۱) چرخه کالوین، Co2 با یک گیرنده ۵ کربنه به نام ریبولوز ۱-۵ بیس فسفات کندانسه شده و تولید ۲ ملکول ۳-فسفو گلیسرات میکند. اما نکته مهم این است که برای تولید و خروج یک قند ۳ کربنه از چرخه لازم است ۳ ملکول Co2 با ۳ مکول ریبولوز ۱-۵ بیس فسفات(RuBP) کندانسه شود که در اینصورت ۶ ملکول ۳- فسفوگلیسرات ایجاد میشود و این ۶ ملکول در فرایند دیگری به ۶ ملکول گلیسر آلدئید ۳-فسفات تبدیل میشوند حال ۱ ملکول گلیسرالدئید۳-فسفات میتواند از چرخه خارج شده و ۵ ملکول باقیمانده مجدداً چرخه را ادامه داده و مجدداً تبدیل به ۳ ملکول ریبولوز۱-۵ بیس فسفات شوند. آنزیم کاتالیز کننده اولین مرحله از این چرخه، ریبولوز ۱-۵ بیس فسفات کربوکسیلاز/اکسیژناز یا روبیسکو نام دارد که در استرومای کلروپلاست واقع است. روبیسکو فراوانترین آنزیم موجود در زمین بوده و ۵۰٪ کل پروتئین کلروپلاست را میسازد.
در مرحله بعد آنزیم دیگری به نام ۳-فسفوگلیسرات کیناز که مانند روبیسکو آنزیم استرومایی است با مصرف ATP، ۳-فسفوگلیسرات را تبدیل به ۱-۳ بیس فسفوگلیسرات میکند. این آنزیم یک گروه فسفریل را از ATP به کربن شماره یک مولکول ۳- فسفوگلیسرات منتقل میکند.
سپس در مرحله آنزیمی دیگری ۶ ملکول ۱-۳ بیس فسفوگلیسرات تولیدی در مرحله قبل توسط آنزیم گلیسرآلدئید۳-فسفات دهیدروژناز با مصرف ۶ ملکول NADPH تبدیل به ۶ ملکول گلیسرآلدئید ۳- فسفات میشوند.
حال گلیسرآلدئیدهای ایجاد شده سه سرنوشت متفاوت خواهند داشت:
۱. ۵ ملکول از ۶ ملکول گلیسرآلدئید۳-فسفات، دوباره چرخه را ادامه داده و ۳ ملکول ریبولوز ۱-۵بیس فسفات میسازند.(ادامه چرخه کالوین).
۲. یک ملکول گلیسر الدید۳-فسفات توسط تریوز ایزومراز به هیدروکسی استن فسفات تبدیل شده و توسط آنتی پورتر Pi/تریوزفسفات از کلروپلاست خارج شده و در جهت سنتز سوکروز به مصرف برسد. سوکروز قند انتقالی گیاهان است و گلوکزو فروکتوز را با اندامها ذخیره مانند دانهها میبرد.
۳. گلیسرالدئید از کلروپلاست خارج نشده و وارد مسیر سنتز نشاسته میشود، نشاسته شب هنگام به مصرف خود گیاه میرسد.