در سیستمهای یوکاریوتی چگونگی پایان رونویسی به خوبی شناخته نشده است به نظر میرسد که مانند سیستمهای پروکاریوتی به وجود ساختاری ویژه یا ردیف U هر دو در انتهای RNA برای پایان رونویسی لازم باشد. علاوه بر این پس از پایان رونویسی با RNA پلیمراز RNA و I پلیمراز II ممکن است در اثر برش ، بیش از هزار نوکلئوتید از انتهای رونوشت اولیه برداشته شود. رونوشت اولیه که RNA اولیه خوانده میشود. محصول مستقیم رونویسی است. بنابراین جایگاه پایان رونویسی این آنزیمها میتواند بیش از هزار نوکلئوتید فرودست جایگاه رمزگردان انتهای RNA های بالغ باشد.
جالب است که توالی شامل 100 تا 200 ریبونوکلئوتید آدنین دار (ra) در انتهای RNA 3های محصول RNA پلیمراز II یافت میشود این توالی که دم پلی A نامیده شده است از روی الگو در DNA ساخته نمیشود. آنزیم پلی A پلیمراز بدون استفاده از الگو ، نوکلئوتیدهای این توالی را به انتهای 3 که از برش رونوشتهای اولیه حاصل شده است میافزاید.
