دانشگاه علوم پزشکی اردبیل در سال 1372 با پذیرش 86 دانشجو در رشته های پزشکی ، پرستاری ، مامایی و کاردانی علوم آزمایشگاهی تاسیس گردید.
دانشکده پزشگی این دانشگاه در سال 1372 با پذیرش تعداد 36 دانشجو در محل بیمارستان بوعلی تشکیل و آغاز به کار کرد و در سال 1375 به ساختمان اصلی نقل مکان نمود.
آموزشکده پیراپزشکی نیز در سال 1375 فعالیت آموزشی خود را آغاز نمود.آموزشکده بهداشت در سال 1375 وابسته به دانشکده پزشکی و پیراپزشکی بود که در سال 1378 از دانشکده های مذکور منفک شده است.
دانشکده پرستاری و مامایی نیز ، همزمان با دانشکده پزشکی در سال 1372 در محل بیمارستان بوعلی فعالیت آموزشی خود را آغاز نمود.
دانشکده پرستاری و مامایی خلخال نیز در سال 1372 افتتاح و با پذیرش 20 نفر دانشجو در رشته کارشناسی پرستاری فعالیت آموزشی خود را آغاز نمود.
دوره های شبانه دانشگاه علوم پزشکی اردبیل نیز در مهر ماه 1374 تاسیس و از طریق آزمون سراسری نسبت به پذیرش دانشجویان در رشته های پرستاری، مامایی، رادیولوژی، هوشبری واتاق عمل اقدام نمود.